整理仪器数据格式
把支持的实验仪器输出整理成 Allotrope 数据格式，便于研究团队统一处理；先核对仪器文件类型和格式要求。
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医学与生命科学 AI 资料工具导航
AI 资源索引与说明
这类资源适合从资料工作切入：整理文献线索、提取研究方法、比较论文结论，或建立带出处的研究笔记。先区分患者资料、公开论文和研究数据，确认工具所需的数据服务与环境。生成的资料摘要需要回到原文核对，检索结果和模型生成内容不能作为诊断、处方或治疗方案的直接依据。
准备、选择与完成任务
- 说明研究问题、纳入范围、时间区间和所需文献类型，尽量从公开或已授权的资料开始。
- 检查资源是否需要文献数据库账号、API 或客户端；按许可和机构要求选择可处理的数据。
- 要求逐条给出出处、研究对象、方法和局限；抽查引用是否存在，以及摘要是否忠实于原文。
可以直接尝试的任务
仅使用所附五篇已公开论文，整理一张研究比较表：研究对象、样本量、设计、主要结果和作者报告的局限。每行注明原文出处；原文未说明的字段写“未报告”，不要补写临床建议。
检查交付结果
- 引用对应真实文献，研究对象、日期和结论范围没有被混淆。
- 未报告的数据明确标记，相关性与因果关系没有被混写。
- 受限资料按许可处理，涉及专业判断的成果交由相应专业人员核验。
可比较的资源与来源说明
开发 Nextflow 研究流程
围绕测序等研究数据编写和调整 Nextflow 分析流程；需准备数据、运行环境与目标分析步骤。
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筛选科研问题
结合研究方向、已有证据和资源约束，梳理候选科学问题与下一步验证计划。
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分析单细胞数据
使用 scvi-tools 的研究工作流处理单细胞数据；需要 Python 环境和可用的数据集。
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检查单细胞 RNA 数据质量
读取单细胞 RNA 研究数据，梳理质量检查指标与处理步骤，辅助研究人员检查数据。
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开始工作流程
面向生命科学研究的工作流程，帮助助手完成「开始工作流程」。准备任务资料，并先安装对应插件或 Skill；具体输入与输出请查看来源说明。
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检查分子研究任务状态
面向分子与蛋白质研究的工作流程，帮助助手完成「检查分子研究任务状态」。准备任务资料，并先安装对应插件或 Skill；具体输入与输出请查看来源说明。
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查询 AlphaFold 蛋白质结构
面向生命科学研究的工作流程，帮助助手完成「查询 AlphaFold 蛋白质结构」。准备任务资料，并先安装对应插件或 Skill；具体输入与输出请查看来源说明。
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分析扩增子微生物组数据
面向测序数据研究的工作流程，帮助助手完成「分析扩增子微生物组数据」。准备任务资料，并先安装对应插件或 Skill；具体输入与输出请查看来源说明。
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配置分子研究工具
面向分子与蛋白质研究的工作流程，帮助助手完成「配置分子研究工具」。准备任务资料，并先安装对应插件或 Skill；具体输入与输出请查看来源说明。
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查询 Bgee 基因表达资料
面向生命科学研究的工作流程，帮助助手完成「查询 Bgee 基因表达资料」。准备任务资料，并先安装对应插件或 Skill；具体输入与输出请查看来源说明。
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选择测序数据分析流程
面向测序数据研究的工作流程，帮助助手完成「选择测序数据分析流程」。准备任务资料，并先安装对应插件或 Skill；具体输入与输出请查看来源说明。
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